Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms