Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HINFPQ9BQA5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HINFPQ9BQA5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HINFPQ9BQA5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HINFPQ9BQA5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HINFPQ9BQA5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HINFPQ9BQA5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HINFPQ9BQA5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HINFPQ9BQA5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HINFPQ9BQA5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HINFPQ9BQA5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HINFPQ9BQA5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HINFPQ9BQA5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HINFPQ9BQA5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HINFPQ9BQA5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HINFPQ9BQA5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HINFPQ9BQA5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HINFPQ9BQA5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HINFPQ9BQA5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HINFPQ9BQA5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms