Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms