Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX3

NCAPG, Condensin complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPGQ9BPX3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPGQ9BPX3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms