Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DUSP9Q99956 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms