Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MYD88Q99836 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MYD88Q99836 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms