Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYSTQ99698 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYSTQ99698 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYSTQ99698 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LYSTQ99698 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LYSTQ99698 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LYSTQ99698 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LYSTQ99698 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYSTQ99698 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LYSTQ99698 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LYSTQ99698 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYSTQ99698 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYSTQ99698 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LYSTQ99698 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYSTQ99698 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYSTQ99698 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LYSTQ99698 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYSTQ99698 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LYSTQ99698 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LYSTQ99698 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYSTQ99698 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LYSTQ99698 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LYSTQ99698 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LYSTQ99698 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYSTQ99698 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYSTQ99698 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LYSTQ99698 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms