Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGREF1Q99674 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CGREF1Q99674 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms