Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPS8Q99627 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms