Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3CQ99613 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms