Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PSMD1Q99460 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMD1Q99460 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms