Protein–RNA interactions for Protein: Q96TC7

RMDN3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN3Q96TC7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RMDN3Q96TC7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RMDN3Q96TC7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms