Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRAMP1Q96RY5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms