Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT7

TUBGCP6, Gamma-tubulin complex component 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP6Q96RT7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBGCP6Q96RT7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBGCP6Q96RT7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBGCP6Q96RT7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBGCP6Q96RT7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBGCP6Q96RT7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBGCP6Q96RT7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBGCP6Q96RT7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBGCP6Q96RT7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBGCP6Q96RT7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBGCP6Q96RT7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBGCP6Q96RT7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBGCP6Q96RT7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBGCP6Q96RT7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBGCP6Q96RT7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBGCP6Q96RT7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBGCP6Q96RT7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBGCP6Q96RT7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBGCP6Q96RT7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TUBGCP6Q96RT7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TUBGCP6Q96RT7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
TUBGCP6Q96RT7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBGCP6Q96RT7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms