Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLIC6Q96NY7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIC6Q96NY7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms