Protein–RNA interactions for Protein: Q96N96

SPATA13, Spermatogenesis-associated protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA13Q96N96 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA13Q96N96 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA13Q96N96 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPATA13Q96N96 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA13Q96N96 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA13Q96N96 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA13Q96N96 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA13Q96N96 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA13Q96N96 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA13Q96N96 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA13Q96N96 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA13Q96N96 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA13Q96N96 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA13Q96N96 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA13Q96N96 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA13Q96N96 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA13Q96N96 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA13Q96N96 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA13Q96N96 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA13Q96N96 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA13Q96N96 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA13Q96N96 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA13Q96N96 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA13Q96N96 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA13Q96N96 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA13Q96N96 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA13Q96N96 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA13Q96N96 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA13Q96N96 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA13Q96N96 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPATA13Q96N96 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms