Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP57Q96MR6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP57Q96MR6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms