Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGD4Q96M96 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGD4Q96M96 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms