Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNBD2Q96M20 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms