Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF354BQ96LW1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF354BQ96LW1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF354BQ96LW1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF354BQ96LW1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF354BQ96LW1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF354BQ96LW1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF354BQ96LW1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF354BQ96LW1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF354BQ96LW1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF354BQ96LW1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF354BQ96LW1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF354BQ96LW1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF354BQ96LW1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF354BQ96LW1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF354BQ96LW1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF354BQ96LW1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF354BQ96LW1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF354BQ96LW1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF354BQ96LW1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF354BQ96LW1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF354BQ96LW1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF354BQ96LW1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms