Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCZQ96LD1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCZQ96LD1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCZQ96LD1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCZQ96LD1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCZQ96LD1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCZQ96LD1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCZQ96LD1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCZQ96LD1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCZQ96LD1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCZQ96LD1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCZQ96LD1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCZQ96LD1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCZQ96LD1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCZQ96LD1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCZQ96LD1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCZQ96LD1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCZQ96LD1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCZQ96LD1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCZQ96LD1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCZQ96LD1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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