Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD3Q96L08 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUSD3Q96L08 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms