Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
PHACTR3Q96KR7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms