Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SERAC1Q96JX3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERAC1Q96JX3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms