Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms