Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CELF6Q96J87 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF6Q96J87 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms