Protein–RNA interactions for Protein: Q96J84

KIRREL1, Kin of IRRE-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIRREL1Q96J84 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIRREL1Q96J84 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms