Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED3Q96IU2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED3Q96IU2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED3Q96IU2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
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