Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RBM17Q96I25 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBM17Q96I25 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBM17Q96I25 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBM17Q96I25 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBM17Q96I25 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBM17Q96I25 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RBM17Q96I25 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBM17Q96I25 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBM17Q96I25 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBM17Q96I25 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RBM17Q96I25 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms