Protein–RNA interactions for Protein: Q96HW7

INTS4, Integrator complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS4Q96HW7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INTS4Q96HW7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
INTS4Q96HW7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms