Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms