Protein–RNA interactions for Protein: Q96H12

MSANTD3, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD3Q96H12 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSANTD3Q96H12 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms