Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BORCS6Q96GS4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms