Protein–RNA interactions for Protein: Q96GJ1

TRMT2B, tRNA (uracil(54)-C(5))-methyltransferase homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT2BQ96GJ1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT2BQ96GJ1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms