Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC35A4Q96G79 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms