Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT9

IFT43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43Q96FT9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT43Q96FT9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms