Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC97Q96F63 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms