Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC10A4Q96EP9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms