Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM44Q96DX7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms