Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PABPC5Q96DU9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PABPC5Q96DU9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PABPC5Q96DU9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PABPC5Q96DU9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PABPC5Q96DU9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PABPC5Q96DU9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PABPC5Q96DU9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PABPC5Q96DU9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PABPC5Q96DU9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PABPC5Q96DU9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PABPC5Q96DU9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PABPC5Q96DU9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PABPC5Q96DU9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PABPC5Q96DU9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PABPC5Q96DU9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PABPC5Q96DU9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PABPC5Q96DU9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PABPC5Q96DU9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PABPC5Q96DU9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PABPC5Q96DU9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms