Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGBD4Q96DM1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms