Protein–RNA interactions for Protein: Q96DE0

NUDT16, U8 snoRNA-decapping enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT16Q96DE0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUDT16Q96DE0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUDT16Q96DE0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms