Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC39Q96DD0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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