Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE7

TTC17, Tetratricopeptide repeat protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17Q96AE7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TTC17Q96AE7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms