Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTSSAQ969W0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms