Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKD1Q969G9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKD1Q969G9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms