Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS3Q969F9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms