Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-CQ95604 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms