Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN4Q92575 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms