Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD9

CASKIN1, Caskin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN1Q8WXD9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CASKIN1Q8WXD9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CASKIN1Q8WXD9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms